学院紧紧围绕立德树人根本任务和“双一流”学科建设目标，抢抓国家“大健康”、长三角一体化等重大发展战略机遇，全面推动人才培养、科学研究、文化传承、社会服务、国际化等事业发展，优化学科布局，着力建设特色鲜明、优势突出的学科体系，以“食品科学与工程”学科为龙头，带动提升学院的学科建设整体水平。

现拥有“食品科学与工程”一级学科博士学位授权点和博士后流动站，新增“生物与医药”工程博士授权点；食品科学与工程、生物学一级学科硕士学位授权点，制药工程二级学科硕士学位授权点；拥有生物与医药（食品工程、制药工程、生物工程方向）、药学硕士专业学位授权点；形成了从本科、硕士、博士到博士后，从学术学位到专业学位的完整人才培养体系。学院的“农产品加工及贮藏工程”二级学科为国家重点（培育）学科和“211工程”重点建设学科；以食品科学与工程学科为支撑的农业科学学科接近ESI全球前0.2%。“食品科学与工程”“制药工程”2个本科专业为国家级特色专业、教育部工程教育专业认证专业与首批国家一流本科专业。2022年新增“食品质量与安全”国家级一流本科专业。

学科建有农产品生物化工教育部工程研究中心、安徽省农产品精深加工重点实验室和中国轻工业肉品微生物控制及利用重点实验室，共建有安徽省休闲食品工程技术研究中心等9个省级工程技术研究中心；现有实验室和基地总面积达18000平方米，设备价值超亿元。

学院现有教职员工169人，其中专任教师154人（含实验教师15人），95%以上具有博士学位；有国家级高层次人才6人。柔性引进了吴清平院士，另聘有国内外知名的兼职教授60余人、外籍教师1人，组成了一支综合素质高、整体结构合理、教学科研能力强、满足多层次人才培养需要的师资队伍，有力支撑了学院的学科建设。